V letech 1991 až 2011 vyšlo patnáct svazků neperiodického vědeckého sborníku Opera historica (Editio Universitatis Bohemiae Meridionalis) zaměřeného na vybraná témata sociálních, kulturních a politických dějin společnosti českých zemí, respektive habsburské monarchie v raném novověku.

Od šestnáctého ročníku vychází Opera historica – Časopis pro dějiny raného novověku dvakrát ročně jako vědecký časopis, který klade důraz především na politické, kulturní a intelektuální dějiny raného novověku v evropských souvislostech. Ke struktuře časopisu patří vědecké studie, aktuální vědecké projekty, materiálové stati s kratšími edicemi pramenů, recenze a glosy o novinkách v raném novověku. O kvalitu časopisu se stará jedenáctičlenná redakční rada a výkonný redaktor. Opera historica – Časopis pro dějiny raného novověku nabízí své stránky všem autorkám a autorům, jejichž původní vědecké texty úspěšně projdou recenzním řízením. Interdisciplinárně pojaté příspěvky považuje redakční rada za jeden z cílů svého dlouhodobého úsilí.